泛指在無自由氧氣分子存在的環境下才能生存的微生物。存在於正常人體，亦會引起嚴重的感染症。現已開發出利用厭氣菌分解廢水中的有機物質，做為生存、繁殖的營養，並產生沼氣能源，可用來發電。